在戰(zhàn)斗的最后取回了自己的世界，各自回到自己應在之處的Gatchaman=健、Tekkaman=城二、Polimar=武士、卡辛=鐵也四人。　　但他們?yōu)榱四硞€目的，而和笑一同再次跨越時空，降臨同一個世界。　　那里，是威脅和平的人類之敵“惡魔黨”大施淫威，與之對抗的Gatchaman率領的“科學忍者隊”不停戰(zhàn)斗的世界。　　但，在對于這個世界的樣子感到違和感的他們面前，一個男人的身影出現(xiàn)了。那是科學忍者隊的創(chuàng)設者南部博士。對本應相識的健露出詭異表情的南部，向英雄們說出了意想不到的話語。“看來你們似乎是我的敵人”……。　　此外，還有一個一直在樓頂窺視他們的身影。那是曾和健一同并肩對抗惡魔黨的，科學忍者隊No.2。　　其名為“神鷹喬”。　　四大英雄的全新激斗，將在銀幕上拉開帷幕！