為了對抗突然出現的人類之敵「涅洛伊」，世界各國組成了聯合軍。但能夠與他們對抗的，僅有具備特殊魔力的少女們而已……。由聯合軍主導的柏林奪還作戰終于啟動，再次成軍的第501統合戰斗航空團「強襲魔女」，在新的501成員「服部靜夏」加入后，與涅洛伊的殊死戰斗逐漸擴大化！究竟柏林的天空能否得到解放！？