這是一個外星人和地球人混居的時代，在外星移民的壓迫和統治下，流傳百年的武士道精神已然沒落，然而，在一片傾頹之勢面前，依然有一群人默默的遵守著他們的準則和正義家道中落的青年志村新八（菅田將暉 飾）在一場意外中結識了萬事屋老板坂田銀時（小栗旬 飾）和天人少女神樂（橋本環奈 飾），三人成為好友。他們共同的朋友桂小太郎（岡田將生 飾）無故失蹤，經過調查，一個名叫岡田似藏（新井浩文 飾）的男人和一把名為“紅纓”的妖刀浮出水面。　　岡田似藏是曾經的攘夷志士高杉晉助（堂本剛 飾）的手下，高杉恨透了這個墮落的世界，一直都企圖將它破壞殆盡。隨著紅纓的力量越來越強大，整個大江戶被籠罩在越來越濃重的陰云之下。