本片講述了四只忍者神龜與蝙蝠俠跨時空相遇，并聯手對抗最強敵人的故事達倫·克里斯配音忍者神龜拉斐爾，SNL的凱爾·穆尼配音米開朗基羅，特洛伊·貝克配音蝙蝠俠和小丑，蕾切爾·布魯姆配音蝙蝠少女，布萊恩·喬治配音管家阿爾佛雷德。